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双黄连组分可能通过抑制新型冠状病毒蛋白酶实现功效

2022/11/30 10:10:25  阅读:482 发布者:

Journal of Exploratory Research in Pharmacology

《药理学探索研究杂志》

文章导读

2019年由SARS-CoV2感染引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情至今已经有三年多的时间,然而,目前全球范围内仍受到疫情困扰,缺乏特效治疗药物。在疫情的防控中,中医药起到了至关重要的作用,其中,双黄连、连花清瘟颗粒等均被报道可有效抑制新型冠状病毒。但对于中医药抑制新型冠状病毒的微观机理,目前仍缺乏合理的阐述。

本研究分析了新型冠状病毒的主要靶点,以其中的PLProMpro作为研究对象,细化结合位点,对双黄连的成分和FDA药物库同时进行虚拟筛选,通过分子对接模拟评估了双黄连中各成分与上述靶点的潜在结合情况,分析每个定义位点的相应结合模式。预测各成分的药代动力学,以初步评估其口服生物利用度。

1 双黄连的主要成分分析

本研究发现,在双黄连所含有的脂肪酸、芳香化合物、糖苷和甾醇类等482中天然产物中,与PLProMpro结合的成功对接率高于FDA药物库。总体来说,“双”(双花)和“连”(连翘)在通过氢键形成重要相互作用方面占据主导地位,即很可能在实现抑制作用方面起决定性作用,而“黄”(黄芩)则表现出对于全局活性的补充。在成药性方面,双黄连的主要成分在极性方面均表现出不利,但可通过搭载传输载体和去糖基化克服。此外,本研究还根据最优活性成分提出了药材的可替代方案。

2 三维结合图显示双黄连中的重要分子能够与活性位点的多个位置有效结合

结论展望

双黄连的有效成分可能通过与PLProMpro相互作用抑制新型冠状病毒,其中,双花和连翘占据主导地位,通过优化改善活性分子的极性以及提出药材替代方案均是具有潜力的研究方向。

本文Virtual Screening of Shuanghuanglian Components for the Binding to the Proteinases of SARS-CoV-2”在期刊Journal of Exploratory Research in Pharmacology上发表,DOI10.14218/JERP.2022.00061

作者简介

通讯作者及第一作者

杨雨顺

金华高等研究院学术骨干,南京大学博士,师从诺贝尔奖获得者阿龙·切哈诺沃。从事药物化学和化学生物学方向的研究,致力于基于人工智能对功能性小分子进行设计、改构和修饰,实现荧光检测工具的研发和优化。获省部级科学技术奖一等奖1项,发表SCI论文90余篇,获发明专利授权10余件,转化100余万元。

通讯作者

杨洁

南京大学生命科学学院教授、博士生导师。主要开展生物大分子的结构与功能研究、高通量药物筛选模型的构建,以及新药研究,建立了糖尿病中药验方数据库(CTMD)。发表SCI论文110余篇.

转自:“华誉学术”微信公众号

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