生物信息学/医学大数据/基因组学/单细胞测序技术

此各课题项目适合专业方向：

生物物理  生物医学工程 计算机科学 生物化学 生命科学等相关专业。

对以下各课题感兴趣的可以首页V申请

微生物基因组学研究课题

课题研究：

程序语言 python perl

学习细菌基因组的重测序（resequencing）数据的基本分析

实验：第二代测序数据的质控分析  Mapping 变异检测（ 包括单碱基多态性位点，片段插入缺少，基因组机构变异等） 和注释，进化分析。

细菌基因组的从头测序（denovosequencing）数据的基本分析

实验：第三代测序数据的组装、基因组注释（包括基因预测、RNA识别、重复序列检测、蛋白功能注释及全基因组序列提交等）和比较基因组分析等。

宏基因组（metagenomics）数据的基本分析

其他相关课题

脑科学/ 神经科学领域研究课题： 阿尔茨海默症（AD）和 帕金森氏症

老年痴呆症和帕金森氏症是全世界第一和第二大高发的神经退行性疾病，也是目前神经科学研究领域的重点和热点。

人类社会已逐渐进入老龄化时代，伴随而来的是老年人神经退行性疾病的普遍发生。老年痴呆症和帕金森氏症是全世界第一和第二大高发的神经退行性疾病，也是目前神经科学研究领域的重点和热点。在帕金森氏症患者脑中，存在破坏神经元正常生理活动的蛋白聚集体，被成为“路易小体”。在这个项目里，你将与实验室的博士后一起并肩作战，应用路易小体的活细胞探针，在小鼠的大脑中发现和鉴别形成的路易小体。通过活细胞成像和膜片钳记录，研究路易小体对神经细胞功能的破坏作用。这些研究经历可以帮助学生初步理解帕金森氏症发病的基本理论，为后续研究神经退行疾病打下基础。

单细胞测序技术课题

肿瘤免疫微环境，细胞内信号转导、细胞间通信、细胞互作等，有机会分析清除肿瘤免疫微环境，了解到疾病机理。单细胞多组学、时空组学等，高维的数据，更清新地展示疾病状态，未来有可能代替病理

，变成临床的标准之一。

单细胞测序技术（scRNA、scATAC、scMethy、scWGS等）大大提高了我们对生物系统的了解，使研究者能够以前所未有的分辨率研究基因表达图谱。这一潜力吸引着更多科研工作者应用单细胞分析技术解决研究问题。特别是在胚胎发育、肿瘤的异质性、表观遗传特征、组织空间动力学以及与肿瘤微环境的相互作用的研究中，单细胞多组学技术能够整合单个细胞的多层信息，是全面理解发育和癌症进化的关键。

但是目前单细胞数据的分析，对于很多研究者来说依然是一个重要的难点。为了方便更多研究者能够更加直观地进行单细胞数据的分析，本项目将以R语言中shiny为框架，搭建一个基于web的单细胞数据分析平台，让使用者能够以网页交互的形式进行单细胞数据分析，进而降低单细胞数据的分析门槛。通过本项目，学员可以系统地学习单细胞测序相关内容，掌握单细胞测序数据的分析技术，了解web开发等相关知识。

研究投稿方向： Cancer Cell、Cell Research、European Urology、Theranostics和EMBO Reports

转自：“北美名校科研”微信公众号

如有侵权，请联系本站删除！