6月7日，南开大学沈中阳及北京大学曹云龙（南开大学为第一单位）共同通讯在Cell Research 在线发表新论文，该研究的人群包括天津 Omicron BA.1 爆发期间的所有 430 例病例。与成人相比，儿童患者的病情较轻。绝大多数（82.5%）儿童患者症状轻微，无重症病例。
该研究发现接受加强剂量灭活疫苗的患者的 ICU 入院率仅为 0.6%，仅接受两剂的患者为 4.8%，均显著低于未接种疫苗患者的 37.5%。接受加强剂量灭活疫苗的患者住院和康复时间较短。
研究人员通过与未接种疫苗的病例相比，检查接种者中的突破性感染，研究了接种疫苗所赋予的保护作用。研究人群包括天津 Omicron BA.1 爆发期间的所有 430 例病例。
430 名患者的中位年龄为 36 岁（四分位距 (IQR)，14-55 岁），其中 26.5% 低于 18 岁。大多数患者出现轻度 (47.7%) 至中度 (50.2%) 疾病，只有 2 名 (0.5% ) 重症病例，无危重症病例，没有死亡记录。最常见的发病症状是咳嗽（37.0%）和发烧（30.2%）；嗅觉异常（1.4%）、异味症（0.9%）、腹泻（0.9%）和皮疹（0.2%）很少见。40.0%的患者至少有一种合并症，其中高血压（17.0%）和肝功能异常（16.0%）是最常见的。
与成人相比，儿童患者的病情较轻。绝大多数（82.5%）儿童患者症状轻微，无重症病例。成年患者主要是中度病例（63.9%）。值得注意的是，儿童患者没有入住 ICU，合并症较少（儿童 3.5% vs 成人 53.2%，P < 0.001），恢复期核酸检测转为阳性的机会较少（12.3% vs 22.5%， P = 0.019）。
在感染 Omicron BA.1 的 430 名患者中，341 名（79.3%）接种了灭活疫苗（54.3% BBIBP-CorV、45.5% CoronaVac 和 0.3% 其他），49 名（11.4%）接种了腺病毒载体疫苗（Ad5-nCoV ），2人（0.5％）接受了重组蛋白亚单位疫苗（ZF2001），38人（8.8％）未接种疫苗。鉴于天津市在 2021 年 10 月 30 日之后启动了 3 至 11 岁儿童的疫苗接种计划，大多数受感染儿童（82.5%）接种了 2 剂灭活疫苗。
根据 341 名接种灭活疫苗的患者（3 剂，n = 157；2 剂，n = 178；1 剂，n = 6）和 38 例未接种 SARS-CoV-2 疫苗的患者的数据，该研究发现，当所有年龄组一起考虑时，与 3 剂相比，2 剂灭活疫苗与无症状至轻度疾病的比例更大（P = 0.003），这可能是因为大多数未成年患者接种了 2 剂灭活疫苗并出现轻度疾病。仅在成年患者中，与未接种疫苗相比，3 剂疫苗可降低疾病严重程度（P = 0.004）。
接受加强剂量灭活疫苗的患者的 ICU 入院率仅为 0.6%，仅接受两剂初级系列的患者为 4.8%，均显著低于未接种疫苗患者的 37.5%（P < 0.001）。接受加强剂量灭活疫苗的患者住院和康复时间较短。对于所有年龄组的患者，接受 3 剂灭活疫苗的患者的住院和康复时间比未接种疫苗的患者短 2 天（P = 0.009）。特别是成人患者，接种3剂（27 vs 30天，P = 0.001）或2剂（28 vs 30天，P = 0.026）灭活疫苗的住院和康复时间比未接种者短。与未接种疫苗的患者相比，接受 3 剂（19.4% vs 50.0%，P = 0.001）或 2 剂（19.0% vs 50.0%，P = 0.002）也与恢复期较低的再阳性率相关。
疫苗接种状态也与免疫和炎症相关的实验室检查结果相关。与未接种疫苗相比，接种 3 剂灭活疫苗的患者在核酸检测转阴后恢复早期的全身免疫炎症指数（SII）和 C 反应蛋白水平显著降低，提示接种灭活疫苗的患者可以加快炎症消退。由于淋巴细胞水平相对较低，接种三剂灭活疫苗的患者中性粒细胞/淋巴细胞比率（NLR）、血小板/淋巴细胞比率（PLR）和单核细胞/淋巴细胞比率（MLR）高于接种两剂疫苗的患者。
在所有年龄组的患者中，高龄是严重疾病的危险因素（优势比 (OR) 1.063，95% CI 1.046-1.080，P < 0.001）。在成年患者中，年龄是严重疾病的不利因素（OR 1.045，95% CI 1.023–1.066，P < 0.001），而 3 剂灭活疫苗是保护因素（OR 0.226，95% CI 0.065–0.784，P = 0.019)。然而，对于儿童患者，在年龄/性别/疫苗接种和疾病严重程度之间未观察到显着相关性。
二元逻辑回归表明，接受 3 剂灭活疫苗是所有年龄段患者进入 ICU 的独立保护因素（OR 0.023，95% CI 0.002–0.224，P = 0.001）。对于所有年龄的患者 (OR 0.317, 95% CI 0.144–0.700, P = 0.004) 和成人患者(OR 0.301, 95% CI 0.117–0.771, P = 0.012)，接受 3 剂灭活疫苗是恢复期间 PCR 复阳性的独立保护因素。接受 3 剂灭活疫苗与更短的住院和康复相关（OR 0.461, 95% CI 0.225–0.946, P = 0.035）。
该研究比较了接受 3 剂 CoronaVac (n = 42) 的 Omicron 恢复期患者与也接种了 3 剂 CoronaVac (n = 114) 的健康个体对 WT、Beta 和 Omicron BA 的中和抗体滴度。对于接受 3 剂 CoronaVac 的 42 名患者，接受第二剂和第三剂之间的中位间隔为 193.5 天（IQR 187.0-212.8）；接受加强剂量和感染之间的中位间隔为 55.5 天（IQR 37.8-75.0）；接受加强剂量和取样之间的中位间隔为 95.5 天（IQR 80.5-116.8）。对于健康接种疫苗的队列，接受第二剂和加强剂之间的中位间隔为 194.5 天（IQR 187.0-210.2）；接受加强剂量和取样之间的中位间隔为 93.5 天（IQR 78.0-113.0）。在中和 WT、Beta 和 Omicron BA.1 时，Omicron 恢复期患者 NT50 的几何平均值分别是健康接种疫苗个体的 2.2、4.5 和 8.7 倍。这些观察结果表明，感染 Omicron BA.1 可以大大提高血浆中和滴度。
这项研究有几个局限性。首先，患者样本少。由于有效的控制措施，疫情很快得到控制，因此病例数量有限。其次，接受最终剂量和感染之间的中位间隔在成人中为 79.5 (43.8-195.3) 天，在儿童中为 48.0 (44.0-59.3) 天。尽管未观察到疾病严重程度与疫苗接种-感染间隔之间的显著相关性，但这种较短的间隔可能归因于在儿童中观察到的症状较轻。最后，由于 2 剂组和 3 剂组的疫苗-感染间隔不同，因此无法比较 3 剂和 2 剂对严重疾病的保护效率。
出版信息
标题:
Disease profile and plasma neutralizing activity of post-vaccination Omicron BA.1 infection in Tianjin, China: a retrospective study
出版信息:
Cell Research，07 June 2022
DOI:
10.1038/s41422-022-00674-2
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PNAS：揭示新冠病毒劫持宿主细胞因子NRP1来感染人体细胞
在一项新的研究中，来自英国布里斯托尔大学、爱沙尼亚塔尔图大学和澳大利亚昆士兰大学的研究人员研究了SARS-CoV-2（造成COVID-19大流行的冠状病毒）如何操纵宿主蛋白以渗透到人体细胞中。
在确定神经菌毛素-1（Neuropilin-1, NRP1）是SARS-CoV-2感染的宿主因子后，他们描述了这种冠状病毒如何破坏宿主细胞途径以感染人类细胞。
SARS-CoV-2继续对全世界的社区和行业产生重大影响。为了寻找阻断SARS-CoV-2感染的创新策略，这些作者发现作为宿主细胞表面上的一种重要受体，NRP1被SARS-CoV-2劫持以增强感染。
NRP1是一种动态受体，通过识别含有特定神经菌毛素结合序列的蛋白（称为配体）来感知微观的细胞环境。通过模拟这种神经菌毛素结合序列，SARS-CoV-2能够破坏这种受体以增强它进入和感染人体细胞。
在这项新的研究中，在论文共同通讯作者、布里斯托尔大学生命科学学院生物化学系教授Peter Cullen博士、Cullen实验室高级研究员Boris Simonetti博士和Cullen实验室研究助理James Daly博士的领导，这些作者如今确定NRP1及其配体在宿主细胞内被一种称为ESCPE-1的蛋白复合物运输。这种蛋白复合物捕获NRP1并调节它在细胞内不同区室之间的运输。
这一途径的功能仍不完全清楚，但是这些作者发现发现，使用基因编辑从人类细胞中去除ESCPE-1，有效地阻止了大约50%的SARS-CoV-2感染，表明这一过程在感染过程中被这种病毒劫持是有益的。
Pete、Boris和James解释说，“这项新的研究代表了对这种大流行性冠状病毒的理解的进步，以及它如何破坏宿主生物学以感染细胞。SARS-CoV-2使用的这一途径的确定为设计治疗性干预措施开辟了途径，这些干预措施可以防止ESCPE-1和NRP1与这种病毒的刺突蛋白结合以减少感染。”
出版信息
标题:
ESCPE-1 mediates retrograde endosomal sorting of the SARS-CoV-2 host factor Neuropilin-1
出版信息:
PNAS，13 June 2022
DOI:
10.1073/pnas.2201980119
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华人团队揭示外泌体可作为诱饵阻断多种新冠突变株
美国西北大学医学院和得克萨斯大学MD安德森癌症中心联合在Nature Communications上发文，研究发现evACE2（血管紧张素转换酶2的细胞外囊泡）可有效阻断新冠病毒对宿主细胞的感染。
在该研究中，研究人员发现新冠患者的血液循环中evACE2表达显著增加，特别是急性期的新冠患者。为了测定新冠患者外周血循环中的evACE2，研究人员建立了一种自动化高通量的方法，MVF，以单粒子分辨率检测和分析血液中EV的表面蛋白。结果发现，相对于健康人群，新冠患者血浆中的evACE2明显升高，尤其是急性期患者，即使是恢复期患者，其evACE2也是显著性升高。
研究人员还发现，evACE2可阻断新冠病毒RBD与宿主细胞ACE2受体的结合以及变异感染。为了分析evACE2对病毒附着和感染的影响，研究人员利用流式细胞技术评估新冠病毒与宿主细胞的结合效果。结果发现，ACE2过表达的HEK细胞和Hela细胞的ev1ACE2和ev2ACE2的IC50分别为77.06 pM 和87.16 pM，rhACE2的IC50为10.37 nM。因此，evACE2阻断新冠病毒RBD与人类宿主细胞结合的效率是rhACE2的120-135倍。研究人员还进一步证明，在新冠病毒野生株感染后，与rhACE2相比，evACE2在阻断新冠病毒感染能力至少提升80倍的中和效果。
基于新冠患者血浆中evACE2的高表达及其阻断新冠病毒感染的效果，研究人员尝试将evACE2作为治疗新冠病毒的诱饵疗法。研究人员使用成熟的hACE2转基因小鼠模型，进行evACE2临床前治疗效果评估。结果显示，低剂量的新冠病毒感染后约2周内完全恢复，而高剂量的新冠病毒感染由于严重的肺损伤死亡率很高。而使用鼻腔递送的evACE2（130 μg）治疗的hACE2小鼠有80%可免受新冠病毒感染引起的死亡。
近几年来，新冠疫情一直威胁着人类的健康以及对人们正常的工作和生活造成了极大的困扰。现有的新冠病毒疫苗和治疗性抗体药物，正在受到突变株的挑战，以色列的一项最新真实世界研究显示，第四针加强注射仍然不能有效防止快速传播的Omicron的突破性感染。而美国也于2021年12月暂停了礼来 （Eli Lilly） 和再生元 （Regeneron） 的新冠单抗药物，原因是其对Omicron的疗效降低。
几乎所有的新冠疫苗和治疗性抗体都是针对病毒的S蛋白，尽管新冠病毒不断突变，但它们仍然是通过ACE2受体来进入和感染人类细胞。evACE2通过与人体细胞表面的ACE2竞争，作为诱饵吸引新冠病毒，因此不管新冠病毒如何突变，都能有效阻断其感染。因此，evACE2有望成为阻断新冠病毒的感染的新利器，为全球抗疫成功提供新希望。
出版信息
标题:
Circulating ACE2-expressing extracellular vesicles block broad strains of SARS-CoV-2
出版信息:
Nat Commun.，20 January 2022
DOI:
10.1038/s41467-021-27893-2
转自：科研之友 ScholarMate
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