学界研圈社会实践

8841.北京大学高毅勤团队JCIM | GPU加速的高性能盲对接方法

[摘要]：英文原题：DSDP:ABlindDockingStrategyAcceleratedbyGPUs通讯作者: 高毅勤，北京大学作者：YuPengHuang,HongZhang,SiyuanJiang,DajiongYue,XiaohanLin,JunZhang,YiQinGao*背景介绍分子对接是药物开发过程中发现候选分子的关键步骤，由确定位点、药物构象采样、打分、排序等步骤组成。在虚拟筛选任务中，... [发表时间：2023/9/28 9:49:39]
8842.《自然》：王潇团队绘制小鼠大脑的高分辨率单细胞空间转录组图谱

[摘要]：美国麻省理工学院化学系/Broad研究所的王潇团队，对小鼠大脑和脊髓中的一百万个单细胞的基因表达以亚细胞的空间分辨率进行了刻画和分析，用空间基因表达定义了更精细的组织区域。北京时间2023年9月27日晚23时，《自然》在线发表了这一研究成果。显微镜的发明让科学家们能够观察和归类神经系统中丰富的细胞形态和类型，了解它们在健康和疾病中的作用。近年来单细胞RNA测序的发展更揭示了大脑中细胞类型组成的复杂... [发表时间：2023/9/28 9:48:08]
8843.《自然—细胞生物学》：铁通过活跃的组蛋白去甲基化和mTORC1推动合成代谢

[摘要]：美国西北大学HosseinArdehali研究小组发现，铁通过活跃的组蛋白去甲基化和mTORC1来推动合成代谢。相关论文于2023年9月25日在线发表在《自然—细胞生物学》杂志上。研究人员介绍，所有真核细胞都需要最低限度的铁来维持合成代谢。然而，细胞感知铁以调节新陈代谢过程的机制尚不清楚。研究人员报告了一种以前未曾描述过的真核生物铁感应途径，在这种途径中，分子铁是维持活跃组蛋白去甲基化和维持促进合... [发表时间：2023/9/28 9:47:40]
8844.《自然—神经科学》：神经元中的IL-12传感可诱导小鼠神经保护性中枢神经系统组织适应并减轻神经炎症

[摘要]：瑞士苏黎世大学BurkhardBecher等研究人员合作发现，神经元中的IL-12传感可诱导小鼠神经保护性中枢神经系统组织适应并减轻神经炎症。相关论文于2023年9月25日在线发表于国际学术期刊《自然—神经科学》。研究人员介绍，IL-12是1型免疫的强大驱动者。矛盾的是，在自身免疫性疾病（包括中枢神经系统疾病）中，IL-12会减轻炎症反应。这些相反特性背后的潜在机制以及参与其中的细胞角色仍然难以捉... [发表时间：2023/9/28 9:47:14]
8845.The Plant Cell | 利用热休克诱导克隆分析体系揭示了水稻茎中细胞命运的逐步建立

[摘要]：茎由节和节间组成，是支撑地上器官并连接根部的茎轴,并使水分运输和溶质交换成为可能。与其他器官相比，茎的发育过程仍然仍然知之甚少，尤其是那些起始节点和节间的发育过程。种子植物的茎由节和节间的重复组成,茎节是叶片与茎的附着点，其中的纵向生长非常有限，而节间是茎的一个区域，它会大幅伸长以提升叶片以捕捉光线（图1）。因此，茎已成为作物育种的重要目标。然而，尽管茎的发育很重要，但对它的研究仍然很少。克隆分析... [发表时间：2023/9/28 9:45:19]
8846.Nature Biotechnology | 曹俊越团队开发新型高通量单细胞组学技术PerturbSci-Kinetics

[摘要]：细胞内的基因表达由转录、RNA加工、RNA降解等生物学过程共同调控。然而，这些复杂而协调的基因表达调控机制在很大程度上尚未被揭示。北京时间2023年9月25日晚23时，美国洛克菲勒大学曹俊越课题组在NatureBiotechnology在线发表文章“PerturbSci-Kinetics：Dissectingkeyregulatorsoftranscriptomekineticsthroughsc... [发表时间：2023/9/28 9:44:36]
8847.Nature Communications | 研究揭示微生物诱导植物气孔免疫的关键机制！

[摘要]：以下文章来源于Ad植物微生物，作者HawkinsNETWORKED（NET）蛋白家族是植物肌动蛋白-膜相互作用的关键分子成分。因此，它们直接与肌动蛋白细胞骨架结合，并定位到膜区。不同的NET蛋白将肌动蛋白与特定的膜连接起来，包括肌动蛋白-液泡相互作用（NET4A）、肌动蛋白-核膜相互作用（NET3A）、肌动蛋白-质膜（PM）相互作用（NET2A）、肌动蛋白-胞间连丝相互作用（NET1A）、肌动蛋白... [发表时间：2023/9/28 9:44:10]
8848.JGG｜清华大学江瑞团队建立单细胞表观基因组学分析工具数据库scEpiTools

[摘要]：单细胞表观基因组学测序技术的发展使得研究者能够在单个细胞的水平上获取多种组学数据，包括染色质开放度、染色质相互作用、DNA甲基化和组蛋白修饰等。这些测序数据为解析细胞异质性、基因调控机制、疾病发生机理提供了充分的基础，相应的方法和工具也随之层出不穷。然而，虽然这些方法和工具快速积累，其研究问题、功能以及对计算资源的需求却参差不齐。因此，建立一个系统整理和归纳这些工具并提供在线分析功能的数据库平台具... [发表时间：2023/9/28 9:43:42]
8849.JIA | 中国农业科学院作物科学研究所基于TNGS构建蚕豆SNP遗传图谱及重要农艺性状基因定位研究

[摘要]：以下文章来源于农业科学微平台，作者李孟伟等蚕豆作为一种重要的粮食、蔬菜、饲料和绿肥兼用作物，在世界广泛种植，我国蚕豆年种植面积和总产量均位居世界第一。蚕豆属于二倍体植物（2n=12），具有庞大的基因组（约为13Gb），巨大的基因组影响了蚕豆遗传图谱构建以及基因定位研究。蚕豆基因定位相关研究大多集中在抗病、抗逆等方面，具体包括抗列当、抗褐斑病、耐寒、耐旱等。此外，也有部分关于开花期、花色定位研究。但... [发表时间：2023/9/28 9:43:10]
8850.【Genome Biol】南科大揭示植物RNA Pol II在基因3’端停顿的调控机制及意义

[摘要]：近日，南方科技大学生命科学学院副教授吴柘课题组和助理教授戴紫薇课题组合作在国际知名学术期刊GenomeBiology发表了题为“Couplingofco-transcriptionalsplicingand3’endPolIIpausingduringterminationinArabidopsis”的研究论文，通过实验结合数学建模，系统探究了模式植物拟南芥RNAPolII转录终止阶段在基因3’端... [发表时间：2023/9/28 9:41:12]

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