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什么是PSM倾向性评分匹配?附零代码实现教程

2022/3/28 14:43:05  阅读:591 发布者:chichi77

随机对照试验(RCT)算得上是临床试验的金标准,也是医学科学发展的重要基石。但是由于实际操作中的困难,某些情况下只能可以进行观察性试验。那么怎么在观察性试验中进行“随机”分组呢?

比如我们手上有一个观察性数据,其中包含100名肺癌患者的数据,200名非肺癌患者的数据,能否从这200例中挑出100例作为对照呢?该如何去挑选呢?人工挑选会不会有选择偏倚呢?

要解决“怎么挑”的问题,就需要引入我们今天的主角-- PSM倾向性评分匹配(propensity score match)。

在非随机分组中,为了减少偏倚和混杂的影响,我们应该尽量保证两组的分配相对均衡,为了实现这个目的,我们可以使用影响试验结果的协变量去分配患者,通过协变量计算出每个受试者的倾向性评分,按照倾向性评分临近关系去匹配分组。可以理解为,通过倾向性评分匹配,我们“随机地”分配了处理组和对照组。

下面我们以一篇2017年在JAMA Oncology上发表的文献为例:“Adjuvant Chemotherapy vs Postoperative Observation Following Preoperative Chemoradiotherapy and Resection in Gastroesophageal Cancer A Propensity ScoreMatched Analysis”,大致关于食管癌切除的术后辅助化疗(Adjuvant Chemotherapyvs术后观察(Postoperative-Observation)的倾向性匹配后的研究,下面是研究中关于倾向性匹配的一部分:

研究者用5POB:1AC)匹配比去分配组别,左边为匹配前信息,右边为匹配后信息。从表中,我们可以看出匹配前的POB vs AC的协变量P值大多小于0.05,差异显著,分配不均衡。匹配后P值大多大于0.05,两组之间没有差异性,分配均衡,减少了混杂和偏倚。

那么问题又来了,如何才能简单的进行倾向性评分匹配呢?懂代码的可以使用SAS或者R进行匹配;如果你是新手小白,或者不想花费太多时间敲代码,就可以使用一下易侕团队开发出来的线上统计小工具EasyR,无需下载,1分钟快速实现PSM倾向性评分匹配。

下面就来给大家分享一下EasyR的倾向性评分模块的使用:

     第一步,在EasyR首页导入数据集或者粘贴数据集。(这里要强烈向大家安利一下复制粘贴导入的方法,很多时候Excel的格式都有各式各样的问题,EasyR可以直接使用粘贴的方式导入,既简单又高效)

     第二步,点击其他功能,选择倾向性评分模块。

     第三步,在左侧选择用来分组的Y,选择用来匹配的协变量X,选择用来标识数据的编号ID,点击运行。结果展示了匹配前后P值以及匹配个数的大致情况。

     第四步,结果解读。结果展示了匹配前后P值以及匹配个数的整体情况,以及每个患者的匹配情况,最后一列就是匹配后的患者编号。

     第五步,点击上图左下角按钮:“点击生成匹配后数据集”,系统会生成匹配后的数据,可在首页数据列表查看或下载。最后一列选择isMatched=1的即为匹配成功的观测值。

最后,回到文章开始提出的问题,从200例非肺癌患者中挑选了100例受试者与100例肺癌患者进行匹配,也可以采用相同的方法进行操作,是不是操作起来特别简单!

EasyR是易侕团队自主开发的一款在线分析工具,功能上也许还有很多欠缺,但是希望通过一些好用的工具,能够帮助大家快速的了解数据的潜在分析价值。欢迎各位小伙伴在使用中反馈,向我们提出意见。

另外回答一下大家可能关心的几个问题:

1. 使用EasyR需要下载软件吗?

不需要。EasyR是一款线上数据分析工具,打开网页就能使用。支持Mac电脑和Windows电脑,甚至也可以用IPAD打开。

2. 目前不是已经有XXX软件、XXX软件,你们为什么还要做一个新工具?

SPSSSAS等软件不同,EasyR是一款在线分析平台,不需要下载,不需要编程,也不需要我们懂太多分析方法,更适合新手小白,我们希望通过好用的工具,让大家快速了解数据潜在的分析价值。

3. 使用EasyR要收费吗?

EasyR目前处于公测阶段,近期内不会收费,大家可以抓紧时间注册哦。

4. 如何打开网站,获得邀请码?

大家在电脑上输入www.easyr.cc 就可以打开了,关注下方微信号“易侕科研”,回复:邀请码,领取邀请码。

好啦,以上就是本次分享的主要内容啦。EasyR目前免费,想要写SCI文章,但是又不懂统计、找不到人帮忙的小伙伴千万别错过哦,快来试试吧!

如有侵权,请联系本站删除!

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