随着网络的不断发展，投稿方式也由原来的邮寄投递变成了在线投递，许多期刊都会在各自的官网中表明在线投稿系统的地址。特别是SCI期刊的投递，邮寄方式已不能满足国外期刊快速便捷的需求，因而，在线投稿也成为了SCI的主要投稿方式之一，但在线投稿却需要我们注意：
一、应注意查询拟投稿期刊的最新要求，以便在稿件的准备中尽早开始遵循期刊的习惯和格式。
二、投稿时应严格遵循期刊的相关要求，按规定的程序填写或添加投稿信息，如投稿信、摘要、文件类型、辅助信息、图件、建议的审稿人等，以满足期刊的要求。
三、Email地址必须准确，有些期刊要求主要作者和通信作者有相互独立的用户名和密码，并且主要是与通信作者进行投稿及投稿后的联系，这也是在投稿时需要注意的。
四、除了Email和FTP投稿形式需要一次性投稿外，通过网页的投稿可以采取暂时保存的形式分多次完成投稿任务，在最终递交稿件前，投稿系统需要作者确认所有项目均已完成并且允许作者修改。通常情况下投稿完成以后就不允许作者对已投的稿件进行修改，除非编辑和出版商要求作者作某些修改。
五、投稿成功以后，作者通常会收到一份来自编辑或系统的确认函，作者可根据确认函提供的稿件编号跟踪稿件状态及进行投稿后的联系（如要求加快稿件处理速度），可通过投稿系统规定的渠道或Email与编辑联络。
六、当稿件需要修改时，编辑会通过邮件通知作者需要修改的细节，作者应该通过指定的方式递交修改稿（投稿系统，Email或FTP）。
在线投稿过程中，成功的将稿件投递出去之后，并不意味着结束，我们还需要做好稿件追踪、稿件退修和稿件修回等工作。
(1)稿件追踪(follow-up correspondence)。如果投稿2周仍无任何有关稿件收到的信息，也可打电话、发e-mail或写信给编辑部核实稿件是否收到。由于好的期刊收到的稿件过多，编辑部可能存在疏漏的情况，为此稿件追踪的工作我们也要做好，这是将我们的稿件提交给期刊审核的第一步，自己都细心留意，那么发表就更难了。
(2)稿件退修(revised manu)。几乎所有的经审查学术水平达到出版要求的自由来稿，在发表前都需要退给作者修改其表述及编辑格式，如压缩文章篇幅、重新设计表格、改善插图质量、限制不规则缩写词使用等。
然而退给作者修改的稿件并不代表文章已经被接受，文章最终接受与否取决于作者对文章关键性重要内容和表述方式的修改能否达到审稿专家及编辑的要求。通常退给作者修改的材料包括原稿、审稿专家意见、(reviewers' comments)和一封编辑的信(covering letter)。当作者收倒退修稿后，首先应该仔细地阅读退修信(modify letter)和审稿专家意见。然后应考虑能否或愿意接受审稿专家或编辑的意见，修改稿件。
在稿件退修中可分为大修和小修两类，大修既是内容基本符合期刊要求，但数据不足或者实验内容不充分等较大的问题需要作者重新补充;而小修一般是指论文的格式或者内容中存在的较小的细节错误。不管是大修还是小修，面对修改意见我们都要做到，合理的地方仔细修改，不合理的地方用于指出。而对于修改我们都要在回信中表明。
(3)如何处理稿件修回?从主编回信和审稿人(reviewer)修回意见可看出文章录用的可能性。主编的回信会特别提到你文章的科学先进性(scientific priority);审稿人对文章总的评价中会提到对文章是否感兴趣(interesting)等;修回不要仓促，反复阅读、理解审稿人的问题。
对每位审稿人提出的意见要逐条回答(response to reviewer1，2，3);对修回稿中已修改的地方要具体标明(page, lines);给主编回信，感谢给文稿提出的修改意见，并指出按修改建议已作的修改，未作修改的地方要说明理由。
那么，许多人会问，在线投稿系统有哪些？常见的投稿系统有：ScholarOneManuscripts，EditorialManager，ElsevierEditorialSystem，EJPress，OpenJournalSystems（OJS），等等；也有些出版者倾向于自己开发投稿系统，如美国物理联合会出版社（AIP）的PeerX-Press，英国物理学会出版社（IOPP）的AuthorServiceandRefereeService，等等。这些在线投稿系统虽然界面风格各有不同，但总体功能十分相似，极大地方便了编者、作者、审稿人之间的联系与沟通，对于提高出版效率、降低出版成本具有非常重要的作用。
除了以上在投稿时我们需要注意的内容外，在选择期刊上也需要我们注意。通常您是怎么选择在线投稿的期刊呢？
您通常用哪种方式寻找目标期刊?有没有在寻找合适的期刊之前大量阅读，并经常阅读?如果是这样，你很有可能会发现与你的研究领域相关的文章通常会在哪些刊物中发表。确定了哪些刊物会发表与你的研究相似的文章将帮助你决定将文章投给哪些期刊。
据数据调查出中国科研作者对SCI期刊投稿选择的理解和操作习惯：其中16.5%是浏览出版商网站;36.4%是搜索引擎;44.1%是来自同事或者导师的推荐;3%是来自其他方式习惯。
期刊选择调查是辑文编译针对丁香园用户展开的一项调查。结果显示，中国科研作者在选择目标期刊和投稿过程中普遍存在的误解和写作误区。辑文编译高级编辑针对这些问题逐一给出了相关建议和指导。就更好选择到目标期刊，辑文编译高级编辑将阐述选择目标期刊的最佳途径：
如前所述，在选择期刊过程中最重要的是确保文章符合期刊的目标与范围。大部分期刊会在网站上说明本刊的目标与范围。
此外，有关文章应如何准备投稿(如格式要求、需要与文章一并提交的表格或声明)等重要信息一般会在期刊网站“作者须知”部分提供。因此，访问出版商网站了解期刊的目标与宗旨以及文章投稿须知是十分重要的。
确定期刊是否合适的另外一个途径是搜索已刊发的相关文章的数据库。在平时要为自己积累，比如：大量阅读，并经常阅读。这样，你很有可能会发现与你的研究领域相关的文章通常会在哪些刊物中发表。确定了哪些刊物会发表与你的研究相似的文章将帮助你决定将文章投给哪些期刊。
通过在线的期刊选择工具也是一个明智的选择。实际上，这些资源可以帮助你发现那些你不曾关注甚至是不知其存在的期刊。
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